Tagliate le zucchine in quattro parti per il lungo e poi a tocchetti. Cospargetele di sale e lasciatele riposare per 30 minuti per togliere il liquido in eccesso.
Tagliate in quattro parti i pomodori, eliminate i semi interni e tagliateli a tocchetti. Tagliate a listarelle il peperone, eliminando i semi e i filamenti bianchi interni. Affettate i gambi di sedano.
Sbucciate, affettate la cipolla e fatela soffriggere con un goccio di olio extravergine d'oliva a fuoco basso. Poi aggiungete i pomodori, il peperone, il sedano, le olive, i capperi e i pinoli.
Aggiungete la passata e fate cuocere per 15 minuti circa.
Nel frattempo asciugate le zucchine e friggetele per qualche minuto in olio caldo, poi prelevatele con la schiumarola e aggiungetele alla caponata.
Proseguite la cottura per altri 5 minuti e per ultimo unite le foglie di basilico, l'emulsione di aceto, zucchero e sale. Spegnete il fuoco, lasciate raffreddare e servite la caponata a temperatura ambiente.